Optimal ist es, den Schlauch der Shisha gemeinsam mit der Shisha einmal im Monat zu reinigen. Dies ist besonders wichtig, wenn verschiedene Tabaksorten geraucht werden, da sich ihr Geschmack im Schlauch festsetzt und sich so die verschiedenen Geschmäcker mischen können. Um dies zu verhindern und einen optimalen Rauchgenuss zu gewährleisten, empfiehlt sich eine regelmäßige Reinigung. Man kann aber auch für seinen absoluten Lieblingstabak einen speziellen Schlauch verwenden, sodass erst gar nicht die Gefahr besteht, dass andere Geschmäcker darin gelangen können. Dennoch ist auch hier auf regelmäßige Reinigung zu achten.

Um den Schlauch zu reinigen, sollte man ihn gut mit Wasser durchspülen und dann zum Trocknen aufhängen, am besten an der frischen Luft. Auch ist es weiterhin empfehlenswert, wenn man den Schlauch nicht länger als ein Jahr verwendet. Die Shisha-Schläuche mit einer innenliegenden Metallverstärkung lassen sich besonders gut reinigen, auch besteht keine Gefahr, dass das Metall rostet. Schläuche die nicht aus Leder oder Kunstleder gefertigt sind, sollten lieber lediglich nach dem Rauchen mittels eines Luftdruckreinigers durchgepustet werden.